-
基因数据处理35之使用samtools和bcftools进行变异分析2--连续处
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-07 热度：56
指令： samtools mpileup -uf Homo_sapiens_assembly19chr20.fasta NA12878_snp_A2G_chr20_225058_longer.sorted.bam | bcftools call -mv NA12878_snp_A2G_chr20_225058_longer.raw.vcf bcftools filter -s LowQual -e '%QUAL20 || DP100' NA12878_snp_A2[详细]
-
基因数据处理26之avocado运行snap-basic有问题
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：116
hadoop@Master:~/xubo/data/testTools/se$ avocado-submit /xubo/avocado/hs2.fq /xubo/avocado/hs38DH.fa /xubo/avocado/test20160527NUMhs2snap /home/hadoop/xubo/data/testTools/se/snap-basic.propertiesUsing SPARK_SUBMIT=/home/hadoop/cloud/spark[详细]
-
工具 | R高效数据处理包dplyr和data.table，你选哪个？
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：156
副标题#e# dplyr和data.table是R的两个高效数据处理包，这两个包有它们各自的优点。dplyr包的语法更加优雅，提供了更易于人类所能理解的自然语言。data.table包的语法简洁，并且只需一行代码就可以完成很多事情。进一步地，data.table在某些情况下执行效率[详细]
-
如何挖掘大数据“钻石矿”? 李克强绘四大路径
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：74
副标题#e# 中新社 刘震 摄 有人将大数据比喻为“21世纪的钻石矿”。如何在新一轮信息化潮流中抢得先机，掘得富矿？中国国务院总理李克强25日在中国大数据产业峰会暨中国电子商务创新发展峰会(以下简称：数博会)上发表致辞时，为此描绘出四大清晰路径。 路径[详细]
-
WindowsXP SP3 AFD.sys 本地拒绝服务漏洞的挖掘过程
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：65
标 题: WindowsXP SP3 AFD.sys 本地拒绝服务漏洞的挖掘过程 时 间: 2013-03-17,15:22:33 这是本人第一次做漏洞挖掘，2月的时候开始研究漏洞挖掘技术，2月24号那天在进行Fuzz测试的时候偶然的发现了一个afd.sys未处理的异常，然后就对这个异常如获至宝的分[详细]
-
520我与大数据有个约会——上海大数据创新应用论坛完美落幕
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：81
副标题#e# 2016年5月20日周五下午，由上海市大数据联盟牵头，慧与(中国)有限公司、联通小沃科技与华院数据共同承办，来自金融服务业、运营商、零售及电商、制造等行业的大数据应用先行者们为各行各业170余位来宾们打开了一扇通向大数据应用落地彼岸的智慧之[详细]
-
基因数据处理31之avocado运行avocado-cli中的avocado问题3-变异
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：122
读入的read为： val fqFile = "hs38DHSE1L100F1.sam" 读取结果： cleanedReads.count:1{"readNum": 0,"contig": {"contigName": "chrUn_KN707963v1_decoy","contigLength": 62955,"contigMD5": null,"referenceURL": null,"assembly": null,"species": nul[详细]
-
基因数据处理32之Avocado运行记录(人造数据集)
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：69
副标题#e# 主要是需要数据正确，如果中间缺少记录，avocado一般不会成功 1.代码： Avocado修改： /** * Licensed to Big Data Genomics (BDG) under one * or more contributor license agreements. See the NOTICE file * distributed with this work for[详细]
-
基因数据处理30之avocado运行avocado-cli中的avocado问题1和2
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：91
问题1： avocado中的run方法中： println("stats.coverage:" + stats.coverage) 调用的是： lazy val coverage = ComputingCoverage.time { ScoreCoverage(inputDataset) } 然后报错： Exception in thread "main" java.lang.UnsupportedOperationExceptio[详细]
-
基因数据处理33之Avocado运行记录(参考基因组)
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：133
1.数据下载： avocaodo的test resource中 2.预处理： cat Homo_sapiens_assembly19.fasta | grep -i -n '' Homo_sapiens_assembly19Head.txt cat Homo_sapiens_assembly19Head.txt cat Homo_sapiens_assembly19.fasta | head -34770016 |tail -787820 Homo[详细]
-
nyoj 28 大数阶乘
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：114
大数阶乘 时间限制： 3000?ms ?|? 内存限制： 65535?KB 难度： 3 描述 我们都知道如何计算一个数的阶乘，可是，如果这个数很大呢，我们该如何去计算它并输出它？ 输入 输入一个整数m(0m=5000) 输出 输出m的阶乘，并在输出结束之后输入一个换行符 样例输入[详细]
-
机器学习中的相似性度量：距离，原来还有这么多类
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：95
副标题#e# 来自：苍梧 - 博客园 链接：http://www.cnblogs.com/heaad/archive/2011/03/08/1977733.html 在做分类时常常需要估算不同样本之间的相似性度量(SimilarityMeasurement)，这时通常采用的方法就是计算样本间的“距离”(Distance)。采用什么样的方法[详细]
-
大数相加，大数相乘和100！
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：161
副标题#e# ???????????? 自从腾讯HR面试被刷后，也就不想找实习了，记住教训吧，没事还有九月份，现在和其他人几个人都加进去了linux3+1实验室，暑假好好干一个暑假。 ??? 大数相加虽然之前写过，但是现在写代码起码也应该有自己的风格和规范了，其实大数相[详细]
-
大数据处理语言：U-SQL 介绍
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：92
副标题#e# 微软宣布了新的 Azure 数据湖（Azure Data Lake）服务，该服务被用于云分析，包括了一个超大规模信息库；一个在 YARN 上建立的新的的分析服务，该服务允许数据开发者和数据科学家分析全部的数据；还有 HDInsight，一个全面管理 Hadoop、Spark、St[详细]
-
Twitter开源大数据实时分析系统Heron：Heron架构
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：139
副标题#e# Heron架构 Heron是Apache Storm的一个直接继承者。从架构角度来看，它与Storm截然不同，但是从API的角度看它是完全向后兼容的。 下面的章节指明了Heron和Storm的区别，描述了Heron背后的设计目标，并解释了其架构的主要组件。 代码库 Heron代码库[详细]
-
大数据分析界的“神兽”Apache Kylin初解
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：162
副标题#e# 转自李栋，来自Kyligence公司，也是Apache Kylin Committer PMC member，在加入Kyligence之前曾就职于eBay、微软。 今天分享的主题是：聊聊“神兽”Apache Kylin的最新特性。本次分享将首先对Apache Kylin进行基本介绍；接下来介绍1.5.x最新版本[详细]
-
kylin-BI工具-tableau9
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：53
副标题#e# Tableau 9 Tableau 9.x has been released a while,there are many users are asking about support this version with Apache Kylin. With updated Kylin ODBC Driver,now user could interactive with Kylin service through Tableau 9.x. Apac[详细]
-
Presto随笔
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：116
解决了什么问题 快读的交互式查询 presto 和hive到底什么关系 http://www.mutouxiaogui.cn/blog/?p=395 和hive在一个层级，都是基于hdfs的。但是presto可以借助hive的元信息找到hdfs上的节点。 presto现在已经可以连接 MySQL postgre hive等了 presto为什[详细]
-
HDOJ/HDU 5686 Problem B(斐波拉契+大数~)
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：137
Problem Description 度熊面前有一个全是由1构成的字符串，被称为全1序列。你可以合并任意相邻的两个1，从而形成一个新的序列。对于给定的一个全1序列，请计算根据以上方法，可以构成多少种不同的序列。 Input 这里包括多组测试数据，每组测试数据包含一个[详细]
-
LightOJ 1370 Bi-shoe and Phi-shoe（欧拉函数）
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：148
题目链接： LightOJ 1370 Bi-shoe and Phi-shoe 题意： 给出n个数，要求对每个数a[i]找一个数x[i]使得小于x[i]且与x[i]互素的数的个数不小于a[i],求出所有x[i]的最小和。 分析： 和最小则每个数对应的x[i]应最[详细]
-
基因数据处理26之bcftools安装和使用
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：69
1.下载： https://github.com/samtools/bcftools 2.安装 make make install 3.结合samtools使用 对排序好的bam数据用samtools生成bcf文件： xubo@xubo:~/xubo/data/testTools/se$ samtools mpileup -ugf ../hs38DH.fa hs2.sort.bam hs2.bcf 由于生成的是二[详细]
-
PrefixSpan序列模式挖掘算法
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-05 热度：80
介绍 与GSP一样，PrefixSpan算法也是序列模式分析算法的一种，不过与前者不同的是PrefixSpan算法不产生任何的侯选集，在这点上可以说已经比GSP好很多了。PrefixSpan算法可以挖掘出满足阈值的所有序列模式，可以说是非常经典的算法。序列的格式就是上文中提[详细]
-
大数据分析查询引擎Impala
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-05 热度：51
副标题#e# 来自标点符的《大数据分析查询引擎Impala》 作者：标点符（钱魏 Way） 链接：http://www.biaodianfu.com/impala.html Impala是Cloudera公司主导开发的新型查询系统，它提供SQL语义，能查询存储在Hadoop的HDFS和HBase中的PB级大数据。已有的Hive系[详细]
-
1.大道至简的数据处理工具（Power Query）
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-05 热度：139
? ?如果你不想学复杂的函数，如果不想学更难的VBA。但你想把数据处分分析工作做好。那么，来吧！这套课程将是你最好的选择。远离繁杂，回归简单与智能化。 ? ?先来看看power query 怎么做些什么。先来展示一下效果图。[详细]
-
9个最佳的大数据处理编程语言
所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-05 热度：55
大数据的浪潮仍在继续。它渗透到了几乎所有的行业，信息像洪水一样地席卷企业，使得软件越发庞然大物，比如Excel看上去就变得越来越笨拙。数据处理不再无足轻重，并且对精密分析和强大又实时处理的需要变得前所未有的巨大。 那么，在巨大的数据集中进行筛[详细]
浙公网安备 33038102330469号